Flynderupgårds Venneforening blev oprettet i 1994, kun kort tid efter, at Frilandskulturcenteret blev oprettet i tilknytning til det eksisterende Flynderupgård Museum.
Venneforeningen var fra første færd en meget vigtig del af den daglige drift af Frilandskulturcentret.
I dag, hvor Flynderupgård består af et levende landbrug, et historisk køkken, og med et velfungerende frivillighedskorps, er “Vennernes” primære indsats at sikre, at de mange aktiviteter året igennem kan gennemføres. De fleste aktiviteter kræver 20-25 aktive for at kunne gennemføres.
Flynderupgård blev fra 1. januar 2021 en selvstændig institution under Kultur- og Turismeudvalget. 1. marts blev der ansat en ny leder, nemlig Michael Gyldendal og efterhånden formes fremtiden for stedet som lystgård, levende landbrug, et kultur- og naturoplevelsessted, og en indgang til Nationalparken, Kongernes Nordsjælland.